Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
DMDP11532 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
DMDP11532 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
DMDP11532 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
DMDP11532 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DMDP11532 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DMDP11532 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DMDP11532 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DMDP11532 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DMDP11532 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms