Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
HSP90AB1P08238 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HSP90AB1P08238 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms