Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SKAP2O75563 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms