Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PDE6DO43924 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PDE6DO43924 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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