Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRKAB2O43741 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PRKAB2O43741 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms