Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GATCO43716 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
GATCO43716 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
GATCO43716 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
GATCO43716 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GATCO43716 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms