Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
USP17L13C9JLJ4 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
USP17L13C9JLJ4 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms