Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULE3

DENND2A, DENN domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND2AQ9ULE3 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DENND2AQ9ULE3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DENND2AQ9ULE3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms