Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII2

ATPIF1, ATPase inhibitor, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATPIF1Q9UII2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ATPIF1Q9UII2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms