Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXH9

TRMT1, tRNA (guanine(26)-N(2))-dimethyltransferase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT1Q9NXH9 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRMT1Q9NXH9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TRMT1Q9NXH9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms