Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
FOXD4L1Q9NU39 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FOXD4L1Q9NU39 RPL23A-204ENST00000422514 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms