Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHST12Q9NRB3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms