Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
YTHDF1Q9BYJ9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YTHDF1Q9BYJ9 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms