Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT67

NDFIP1, NEDD4 family-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDFIP1Q9BT67 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDFIP1Q9BT67 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDFIP1Q9BT67 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms