Protein–RNA interactions for Protein: Q99459

CDC5L, Cell division cycle 5-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC5LQ99459 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CDC5LQ99459 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CDC5LQ99459 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms