Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY0

ZC2HC1A, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1AQ96GY0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZC2HC1AQ96GY0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZC2HC1AQ96GY0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZC2HC1AQ96GY0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZC2HC1AQ96GY0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZC2HC1AQ96GY0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ZC2HC1AQ96GY0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms