Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
MRPL53Q96EL3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms