Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATRIPQ8WXE1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATRIPQ8WXE1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms