Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
LINC00269Q8N2A0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
LINC00269Q8N2A0 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms