Protein–RNA interactions for Protein: Q71RC9

SMIM5, Small integral membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM5Q71RC9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMIM5Q71RC9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMIM5Q71RC9 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms