Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LRSAM1Q6UWE0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LRSAM1Q6UWE0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms