Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LARP1Q6PKG0 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LARP1Q6PKG0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms