Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RGMBQ6NW40 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RGMBQ6NW40 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms