Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HMBOX1Q6NT76 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms