Protein–RNA interactions for Protein: Q6F5E8

CARMIL2, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL2Q6F5E8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CARMIL2Q6F5E8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CARMIL2Q6F5E8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms