Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLHL40Q2TBA0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KLHL40Q2TBA0 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms