Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SSX1Q16384 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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SSX1Q16384 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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SSX1Q16384 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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SSX1Q16384 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
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SSX1Q16384 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
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SSX1Q16384 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SSX1Q16384 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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