Protein–RNA interactions for Protein: Q14574

DSC3, Desmocollin-3, humanhuman

Predictions only

Length 896 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC3Q14574 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DSC3Q14574 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DSC3Q14574 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms