Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CIRBPQ14011 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
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