Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
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PDE7AQ13946 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
PDE7AQ13946 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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