Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CACNA1CQ13936 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA1CQ13936 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms