Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP1Q13835 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP1Q13835 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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