Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHAF1BQ13112 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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