Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NFX1Q12986 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.27■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms