Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GRIN2AQ12879 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GRIN2AQ12879 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
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