Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNH2Q12809 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNH2Q12809 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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