Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CPSF1Q10570 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CPSF1Q10570 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms