Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
LRP1Q07954 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
LRP1Q07954 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms