Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
CXCL9Q07325 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CXCL9Q07325 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms