Protein–RNA interactions for Protein: P78362

SRPK2, SRSF protein kinase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK2P78362 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SRPK2P78362 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
SRPK2P78362 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPK2P78362 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SRPK2P78362 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms