Protein–RNA interactions for Protein: P54920

NAPA, Alpha-soluble NSF attachment protein, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAPAP54920 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NAPAP54920 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NAPAP54920 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NAPAP54920 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NAPAP54920 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms