Protein–RNA interactions for Protein: P40617

ARL4A, ADP-ribosylation factor-like protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL4AP40617 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ARL4AP40617 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ARL4AP40617 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms