Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP1P29466 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP1P29466 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP1P29466 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP1P29466 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms