Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HOXA5P20719 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms