Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC159P0C7I6 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC159P0C7I6 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms