Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPINK4O60575 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms