Protein–RNA interactions for Protein: O00411

POLRMT, DNA-directed RNA polymerase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLRMTO00411 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
POLRMTO00411 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLRMTO00411 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms