Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAXBP1Q9Y5B6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAXBP1Q9Y5B6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms