Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y215

COLQ, Acetylcholinesterase collagenic tail peptide, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLQQ9Y215 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
COLQQ9Y215 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
COLQQ9Y215 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLQQ9Y215 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COLQQ9Y215 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms