Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB1

NRXN1, Neurexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN1Q9ULB1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
NRXN1Q9ULB1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NRXN1Q9ULB1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms